Water SARS-CoV-2 RT-PCR Test

Acque reflue non trattate che non è stato sottoposto a depurazione chimica.

Il test Water SARS-CoV-2 RT-PCR è un test di reazione a catena della polimerasi inversa (RT-qPCR) che rileva e quantifica l’RNA del virus in un campione di acque reflue debitamente preparato per l’analisi.

Se utilizzato con un protocollo di concentrazione da 105 ml, la più bassa concentrazione di SARS-CoV-2 che può essere rilevata dal test RT-PCR per il SARS-CoV-2 nelle acque reflue è di circa 1 copia del gene/1 ml.

Se utilizzato con la procedura end-to-end di IDEXX, il test è stato validato per fornire un recupero altamente coerente del SARS-CoV-2 nelle acque reflue.

Il protocollo validato da IDEXX concentra il virus SARS-CoV-2 da 105 ml di acque reflue. Con sistemi di centrifugazione appropriati, il personale di laboratorio può analizzare volumi più o meno grandi eseguendo la procedura di base adattata per diversi volumi di input.

Il test RT-PCR per il SARS-CoV-2 analizza 5 µl di RNA estratto preparato da un campione concentrato di acque reflue, sebbene si consigli di avere a disposizione un volume aggiuntivo per tenere conto della perdita nel pipettaggio e per disporre di duplicati del campione.

IDEXX fornisce un esempio di protocollo di concentrazione basato sulla centrifugazione e sulla precipitazione con polietilenglicole (PEG), che è stato validato per fornire risultati coerenti. Questo protocollo può essere modificato per soddisfare le esigenze specifiche del laboratorio. Inoltre, è possibile utilizzare altri metodi di concentrazione come l’ultrafiltrazione, la filtrazione a collettore ecc. I clienti hanno utilizzato questi metodi di concentrazione con successo con i reagenti IDEXX. Questi metodi necessitano di validazione per verificarne le prestazioni.

Mantenere il campione a basse temperature contribuisce a prevenirne la degradazione e a garantire la precipitazione efficiente del virus SARS-CoV-2.

Il test Water SARS-CoV-2 RT-PCR è stato validato per l’utilizzo con il IDEXX Water DNA/RNA Magnetic Bead Kit per l’estrazione di acidi nucleici da un concentrato di acque reflue, incluso l’RNA del virus SARS-CoV-2. Il test può essere utilizzato in combinazione con altri kit di estrazione, che alcuni clienti hanno impiegato con successo con i reagenti RT-qPCR di IDEXX.

Le acque reflue costituiscono una matrice estremamente complessa e la loro sorveglianza richiede una vasta quantità di materiali di controllo. Per una descrizione completa della procedura end-to-end e dei controlli richiesti e raccomandati, si prega di consultare il rapporto Complete IDEXX Wastewater Surveillance Protocol.

Per le condizioni di conservazione raccomandate al momento della ricezione del prodotto e in seguito a ricostituzione/primo utilizzo, si prega di consultare il foglio illustrativo.

I Centri per la prevenzione e il controllo delle malattie statunitensi (Centers for Disease Control and Prevention, CDC) indicano che per l’analisi di campioni ambientali, compresi la manipolazione e il trattamento di campioni di acque reflue associati al virus SARS-CoV-2, è possibile avvalersi di un laboratorio di livello di biosicurezza 2 (BSL-2) che adotti precauzioni aggiuntive. È disponibile una guida specifica in lingua inglese redatta dai CDC statunitensi: Interim Laboratory Biosafety Guidelines for Handling and Processing Specimens Associated with Coronavirus Disease 2019 (COVID-19).⁴

Per raccomandazioni specifiche consultare le autorità sanitarie locali.

Si prega di seguire le procedure raccomandate dalle autorità sanitarie locali per la manipolazione e il trattamento dei campioni di acque reflue associati al virus SARS-CoV-2. I CDC statunitensi hanno pubblicato una fonte per maggiori informazioni: Interim Laboratory Biosafety Guidelines for Handling and Processing Specimens Associated with Coronavirus Disease 2019 (COVID-19).⁴

Si prega di attenersi alle normative e alle linee guida in materia di sicurezza stabilite a livello locale. 

Se ritenuto opportuno, è possibile utilizzare un processo di trattamento termico facoltativo per inattivare i campioni mediante pastorizzazione. Per un esempio, consultare il foglio illustrativo del prodotto. 

Una fase di pastorizzazione può ridurre il rilevamento dell’RNA del virus SARS-CoV-2. Per ulteriori informazioni si prega di contattare un rappresentante IDEXX.

Smaltire tutti i campioni e i materiali in conformità con le linee guida e le normative locali.

Il test Water SARS-CoV-2 RT-PCR non dispone dell’approvazione dell’EPA per i test di rilevamento del virus SARS-CoV-2 nelle acque reflue. Attualmente l’EPA non regolamenta i test per l’individuazione del virus SARS-CoV-2 nelle acque reflue né approva relativi metodi di analisi. I test per il SARS-CoV-2 nelle acque reflue possono essere regolamentati o meno dalle autorità locali e/o municipali. È opportuno informarsi sulle disposizioni eventualmente vigenti nel proprio Paese.

Sì, il test Water SARS-CoV-2 RT-PCR è compatibile con o comprende tutti i controlli e i processi raccomandati dai CDC per la presentazione dei dati all’NWSS. Per una descrizione completa della procedura end-to-end comprensiva dei controlli richiesti e raccomandati, si prega di consultare il rapporto Complete IDEXX Wastewater Surveillance Protocol.